十五日，太宗命令礼部尚书、江夏王李道宗带着符节送文成公主入藏。吐蕃赞普大喜，拜见李道宗时，完全按照子婿的礼节。
赞普喜欢唐朝的服装和仪仗的美丽，把文成公主安置在布达拉宫，自己穿着丝绸的衣服与公主见面。吐蕃人都喜欢用红褐色的颜料涂在脸上，公主十分讨厌，赞普于是下令从此不准涂脸，并逐渐改变自己猜忌粗暴的性格，还派遣子弟去长安学习礼仪。
李承乾谋反
魏王李泰颇有才能，很受太宗宠爱。他看见太子李承乾患有足病，便想夺位，于是礼贤下士，博取名声。
太宗让黄门侍郎韦挺负责替魏王管理府内事务，后来工部尚书杜楚客代替了他，二人都为李泰结交朝廷里的官员。杜楚客有时候用黄金贿赂并游说权贵，说魏王才能昭著，应当立为太子。文武大臣很多都依附过来，暗中结为朋党。
李承乾害怕李泰夺去自己的位子，派人冒充魏王府典签秘密上奏，把李泰的罪恶都罗列在上面。太宗命令逮捕上奏的人，却没有收获。
李承乾与太常寺的乐童称心私下里玩耍，还和他同起同睡。道士秦英、韦灵符会用妖术，也被李承乾宠幸。太宗对李承乾的行为十分生气，把称心等人全都抓起来杀掉，还连坐处死了几个人，最后又狠狠地责备了李承乾一顿。
李承乾认为是魏王李泰告发的，对他恨之入骨。李承乾对称心很是思念，于是在宫里修造了一间房屋，竖立称心的塑像，早晚祭奠，而且常常在屋里悲伤地大哭。又在宫苑里修建了一个坟冢，私下追赠称心官爵，并树立石碑。
太宗对李承乾越来越不喜欢，这一点李承乾也知道，一连几个月借口生病，不去朝见太宗。而是偷偷地豢养刺客纥干承基等人及100多名壮士，准备暗中杀掉李泰。
吏部尚书侯君集的女婿贺兰楚石担任东宫千牛，李承乾知道侯君集不满朝政，多次让贺兰楚石带侯君集到东宫，向他询问如何保全自己的问题。
侯君集认为李承乾愚昧昏庸，想利用承乾的无知，于是告诉他应该谋反，并举起双手对李承乾说：“这一双好手，当为殿下服务。”
又说：“皇上很宠爱魏王，我担心殿下会像隋太子杨勇那样，有被贬为庶民的危险。如果有敕令宣召殿下进宫，应当提前准备。”
李承乾采纳了这个建议，于是重金贿赂侯君集以及左屯卫中郎将李安俨，让他们对太宗进行刺探，并向他汇报。李安俨以前侍奉隐太子李建成，李建成失败时，李安俨为他拼死战斗，太宗认为他忠诚，所以非常信任他，让他掌管宿卫。到这时，李安俨彻底投靠了李承乾。
劝李承乾谋反的还有汉王李元昌，他说：“最近看见皇上身边有一个美人，琵琶弹得很好，事成之后，希望能把她赐给我。”李承乾答应了。
洋州刺史、开化公赵节是赵慈景的儿子，高祖的女儿长广公主是他的母亲。驸马都尉杜荷是杜如晦的儿子，他的妻子是城阳公主。二人都和李承乾亲近，参与了谋反。
凡是参与谋反的人，都割破手臂，用绢帛沾上血，并把它焚成灰洒进酒里喝下去，发誓生死与共，于是暗中谋划率兵闯入西宫。
杜荷对李承乾说：“天象有变化，要想顺应天象，只能提早发兵。殿下只要声称得了急病，危在旦夕，皇上一定会驾临探望，这样便能成功。”
齐王李祐在齐州谋反失败的事被李承乾听说了，他对纥干承基等人说：“我住的东宫西墙，离大内只有20步，与你们谋划大事，哪能会像齐王那样！”
恰好，因为处理李祐谋反的事，纥干承基受到牵连，被关进大理寺监狱，论罪应当处死。
贞观十七年（公元643年），四月初一，纥干承基奏明皇帝说是李承乾将谋反。太宗敕令长孙无忌、房玄龄、萧瑀、李世与大理寺、中书省、门下省一起参与审查，果然搜到了许多谋反的罪证。
太宗对左右侍臣说：“对承乾要怎样处置？”
没有哪个臣子敢回答这个问题。最后，通事舍人来济进言说：“如果最后陛下不失为慈父，太子又能享尽天年，能够这样的就是最好的解决方式。”太宗听从了。
初六，太宗下诏，把李承乾废黜为平民百姓，幽禁在右领军府。太宗想赦免李元昌的死刑，群臣据理力争，最后他在家中自杀，宽恕了他的母亲、妻子和儿女。侯君集、李安俨、赵节、杜荷等人都依法处斩。
左庶子张玄素、右庶子赵弘智、令狐德棻等人因为没有及时规劝，以连坐罪而免除官职，废为庶民。其他应当连坐获罪的，全都赦免。詹事于志宁因为多次劝谏，受到太宗的单独奖励。任命纥干承基为祐川府折冲都尉，封爵平棘县公。
侯君集被囚禁在监狱里，贺兰楚石又入宫告发他谋反的事，太宗召见侯君集，对他说：“朕不想让那些刀笔吏羞辱你，所以亲自对你审问。”
最开始，侯君集不承认自己的罪行，太宗召见贺兰楚石，贺兰楚石详细陈述事情的始末，又拿出侯君集与李承乾的来往书信给他看，侯君集言辞穷尽，只好认罪。
太宗对身边侍臣说：“侯君集有功劳，这些功劳抵消他的死刑，可以吗？”群臣都认为不可以。
于是太宗对侯君集说：“再见了！”说完流泪，侯君集也伏在地上叩头。
太宗将侯君集在街市斩首，侯君集临刑前，对监刑将军说：“因为我一时的贪念而到如此地步！但我当年在秦王府侍奉陛下，攻取吐谷浑、高昌二国，立下功劳，希望陛下可以让我的儿子保全一个，别断了我们侯家的香火。”太宗就把他的妻子和子女都宽恕了，把他们全部迁到岭南。
当初，太宗让侯君集跟李靖学习兵法，侯君集对太宗说：“李靖想要谋反。”
太宗问他原因，侯君集回答说：“李靖把精华的部分都隐藏起来，只教我一些粗浅的东西，因此知道他要谋反。”
太宗于是询问李靖，李靖回答说：“想要谋反的是侯君集。现在中原已经平定，我教他的兵法，制服四方蛮夷已绰绰有余，而他坚持要求我把所有的谋略都教给他，不是要谋反，又是为了什么呢？”
江夏王李道宗曾经对太宗说：“侯君集虽然有远大志向却智慧很少，自认为有些小功劳，因为没有房玄龄和李靖的地位而感到羞耻，虽然被任命为吏部尚书，还是不能满足他的心愿。依我看，他一定会作乱。”
太宗说：“以侯君集的才能，他可以做任何事情！朕不是吝啬高官的职位，只是按顺序还没排到他，他怎么可以随便猜疑呢！”
等到侯君集因谋反被处死，太宗当面感谢李道宗，说：“你果然说对了。”
太宗慎立太子
贞观十七年（公元643年），太子李承乾因为谋反获罪下狱，随后被幽禁起来。魏王李泰自此每天进宫侍奉太宗，太宗想立他为太子，并和他有了口头协定。岑文本、刘洎也劝太宗立李泰，长孙无忌则坚持要求立晋王李治为太子。
褚遂良字登善，唐初大臣、书法家。
太宗对身边的侍臣说：“昨天李泰扑在我怀里对我说：‘陛下，我今天才真正成为您的儿子，这是我的再生之日。我有一个儿子，我在临死前一定会杀了他，让陛下将来好传位给晋王。’谁不疼爱自己的儿子，朕听李泰这么说，对他很同情。”
谏议大夫褚遂良说：“陛下的话错了。希望谨慎考虑，千万不要有差错发生。陛下百年以后，魏王拥有天下，怎会愿意杀掉自己疼爱的儿子让晋王登基？
“以前陛下既已立李承乾为太子，又宠爱魏王，甚至对李承乾的宠爱还不及对魏王的宠爱，以致酿成现在的灾祸。事情过去不远，现在正好用来借鉴。陛下现在如果要立魏王为太子，希望先安置好晋王，这样才能够安稳。”
太宗流着泪说：“我怎么能这样做！”说完，起身回宫。
李泰唯恐太宗立李治为太子，对李治说：“你与李元昌关系很好，大家都知道了李元昌谋反的事，你不担心吗？”
李治听了的确很担心，而且忧虑写在了脸上。太宗觉得奇怪，多次问他原因，李治就如实回答了他。太宗很失落，开始后悔以前对李泰说的话。
太宗曾经当面责备李承乾，李承乾说：“我是太子，还要求什么啊？只是因为李泰图谋不轨，我有时与朝臣谋求保全自己的策略，一些人胁迫我做不轨之事。现在如果立李泰为太子，那就正好落入他的圈套。”
太宗亲自驾临两仪殿，屏退群臣，只留长孙无忌、房玄龄、李世、褚遂良四人。太宗对他们说：“我的三个儿子、一个弟弟，所作所为竟然这样，我很难过啊。”
说完，太宗撞向床头，长孙无忌等人争相上前抱住。太宗又想拔刀刺自己，褚遂良夺下刀，交给了李治。
长孙无忌等人请求太宗说明心意，太宗说：“朕想立晋王为太子。”
长孙无忌说：“谨奉诏令。有不同意见的人，臣请求将他斩首。”
太宗对李治说：“你的舅舅已经答应，你应当向他拜谢。”李治于是拜谢长孙无忌。
太宗对长孙无忌等人说：“你们已经同意我的意见，外面的情况呢？”
众人回答：“晋王仁义孝敬，天下归心已久，陛下可以询问文武百官，如果有反对的，就是臣等辜负陛下，罪该万死。”
太宗于是驾临太极殿，让六品以上官员入朝觐见，对他们说：“李承乾大逆不道，李泰居心险恶，都不能立为太子。朕想选一位继承人，谁可以担当？你们可以明说。”
众人都欢呼说：“晋王仁义孝敬，做太子非常适合。”太宗十分高兴。
当天，100多名骑兵在李泰率领下到永安门。太宗敕令守门的官员拦住他的骑兵，带李泰进入肃章门，把他幽禁在北苑。
四月初七，太宗正式下诏，立李治为太子。太宗对左右侍臣说：“我如果立李泰为太子，那就说明太子之位就可以凭借阴谋诡计而得。从今往后，凡是太子无道，而有藩王窥伺，两个人都弃置不用。这个规定要传给子孙，永远让后人效法。而且如果立李泰若为太子的话，李承乾和李治都不能保全；如果立李治为太子，李承乾与李泰都能安然无恙。”
唐太宗征高丽
高丽王高武被高丽人盖苏文杀死，盖苏文立高武的侄子高藏为王，自封为莫离支，其官职相当于大唐的吏部兼兵部尚书。
唐太宗得知后，与大臣商议，认为攻取高丽不难，只因不愿打扰百姓，所以应该等他们更加骄横、作恶更多后，再去讨伐。
唐太宗贞观十七年（公元643年）九月，新罗派使者来，他们国家的40多座城池被百济攻取了，百济又与高丽军队联合，想要断绝新罗给大唐进贡的道路，请大唐出兵援救。太宗命令司农寺丞相里玄奖带着皇帝的玺书前往高丽，对他们说：“新罗归顺大唐，朝贡不少，你们不要打了，如果继续攻伐，明年就发兵攻打你们。”
次年七月，太宗打算征讨高丽，下令建造用以运送军粮的船。又下诏派遣营州都督张俭等人督率幽、营二都督府的士兵，以及契丹、奚、靺鞨的军队，先试探性地攻打辽东以观察形势。
十一月，刑部尚书张亮被任命为平壤道行军大总管，率领士兵4.3万人、战舰500艘，从莱州入海，直趋平壤；任命太子詹事、左卫率李世为辽东道行军大总管，率领步、骑兵共6万人，以及兰、河二州投降的胡人军队，前往辽东。两军相互配合，呼应前进。
李世率军从柳城出发，多方营造声势，做出将要取道怀远镇的样子，实际上却一路向北，前往甬道，给高丽来了个出其不意。
贞观十九年（公元645年），四月初一，李世从通定从容渡过辽河，抵达玄菟。高丽人大惊，各城都闭门坚守。
十五日，李世、江夏王李道宗进攻高丽盖牟城；二十六日，盖牟被攻下，抓获俘虏两万多人，缴获粮食10多万石。五月初二，大军进军到辽东城下。初八，来援的高丽骑兵被打败。
太宗自二月亲率军队从洛阳出发，五月时车驾已到辽东。初十，太宗车驾渡过辽水，随即撤除浮桥，以此坚定将士们的决心。
太宗亲自带领数百骑兵来到辽东城下，看见战士们为填壕沟在背土，就分了很重的一块土，在马上抬着，于是随从官员争着把土背到城下。
李世不分昼夜猛攻辽东城。到了第十二天，太宗带领精兵与他会合，把城团团围住，围了许多重。
十七日，南风刮得很大，太宗派勇士爬到冲竿顶上，把西南角的城楼给点着了，火借风势，延烧到城里。然后指挥将士们攀登城墙，高丽守军抵挡不住，辽东城被攻克。1万多人被唐军杀死，唐军俘虏高丽士兵1万多人、男女百姓4万人。
二十八日，唐军继续攻打白岩城。在第二天的战斗中，右卫大将军李思摩中了弩箭，太宗亲自为他吮血。将士们知道后都深受感动。
六月初一，李世攻打白岩城西南边，太宗亲征城西北方向。城主孙代音偷偷派心腹请求投降，约定唐兵临近城池时扔出刀斧为信号，说：“我愿意投降，城里所有人都听我的。”
太宗给使者唐朝的旗帜，说：“一定投降的话，可以把旗子插在城墙上。”孙代音插上旗子，城里的人以为唐朝军队已经登上城楼，于是都投降了。
十一日，唐朝大军从辽东城出发。二十日到达安市城下，发兵攻打。二十一日，高丽北部首领高延寿、高惠真率领的高丽、靺鞨士兵15万人都被唐军一一击败，高延寿、高惠真带领部下3.6万人请求投降，太宗活埋了俘虏的3300名靺鞨士兵。
八月初十，唐军将营帐迁移到安市城南。太宗在辽东，凡是设立营帐，只设立明哨，而不设堑壕堡垒。即使离高丽的城池很近，高丽人也不敢出城袭掠，士兵或单独出行，或是在野外宿营，就像在中原一般。
九月，各路大军紧急进攻安市城。城里鸡和猪的叫声被太宗听见，于是对李世说：“围攻了这么久，城里炊烟越来越稀少，现在鸡和猪叫得厉害，一定是在犒劳士兵，想偷袭唐朝军队，应当严加防备。”当天夜里，高丽几百士兵顺绳爬下城墙。太宗听说后，亲自到城下召集士兵紧急围攻，斩首几十人，剩余的高丽兵退逃。
李道宗率领部下在城东南角堆筑土山，渐渐逼近城墙，城里也用同样方法抵抗。士兵们轮番交战，每天互相拼杀七八次。唐军用冲车发射石块，撞坏城墙，城里随即用木栅堵住缺口。李道宗的脚受伤，太宗亲自为他针灸。
唐军昼夜不停地堆筑土山，花费了三个月，劳力50万人，山顶离城有几丈远近，可以向下监视城内情况。李道宗让果毅都尉傅伏爱率领士兵在山顶驻守，防备高丽兵，结果土山坍毁，压向城墙，城墙塌陷。恰好当时傅伏爱私自离开营垒，高丽几百名士兵进攻城墙缺口处，夺取了土山，在那里挖掘沟堑守卫。
太宗大怒，斩杀傅伏爱示众，命令众将领攻城，三天都无功而返。李道宗光着脚到太宗的旗下请罪。太宗说：“你应该死，但是朕认为汉武帝斩杀大将王恢，不如秦穆公重新任用孟明，况且你有攻破盖牟、辽东的功劳，所以特别赦免你。”
太宗攻不下安市，认为辽东天气寒冷得早，不利于交战，士兵和马匹难以久留，而且粮食快要吃完，命令不日班师回朝。先让辽东、盖牟二州的百姓渡过辽水，于安市城下炫耀兵力后，率领大军撤退，城中守军都不敢轻举妄动。
太宗东征的结果是：攻克了玄菟、横山、盖牟、磨米、白岩、辽东、卑沙、麦谷、银山、后黄10座城池，迁徙辽、盖、岩三州户口共7万人加入唐朝户籍。新城、建安、驻跸三次大战，杀死高丽兵4万多人，唐朝将士死了近两千人，战马损失十之七八。太宗对于这个结果表示十分难过，感叹地说：“如果魏征还在，肯定是不会让我出兵的！”
武则天当皇后
唐太宗贞观二十三年（公元649年）五月，唐太宗李世民去世，太子李治登基，也就是唐高宗。高宗立太子妃王氏为皇后。
